Tradicionalmente la electroforesis bidimensional (2DE) ha sido la tecnología de elección para la identificación de proteínas diferencialmente expresadas que pudieran ser utilizadas como marcadores diagnósticos en enfermedades como el cáncer. Proteomika trabaja activamente en la implementación de nuevas técnicas complementarias para la identificación y validación de biomarcadores como NAPPA o métodos basados en espectrometría de masas cuantitativa.
El estudio diferencial supone la generación de proteomas 2D de multitud de individuos representativos de cada una de las poblaciones en estudio (GE Healthcare). Posteriormente dichos proteomas son digitalizados y comparados mediante software especializado en la interpretación de imágenes 2D que implementan potentes algoritmos para la detección y cuantificación de spots y garantizan un análisis fiable y efectivo (Nonlinear Dynamics).
Proteomika ha llevado a cabo numerosos programas de identificación de biomarcadores en diferentes patologías humanas mediante el análisis proteómico diferencial de miles de muestras biológicas de pacientes e individuos control, registrando aquellas proteínas cuyo patrón de expresión se encuentre alterado significativamente entre los grupos de interés.
La tecnología 2D, como cualquier otra técnica ómica, es un potente método de screening que produce una alta cantidad de información que debe ser filtrada y evaluada con las herramientas estadísticas adecuadas. Proteomika dispone de un equipo bioestadístico para la validación y análisis exhaustivo de estos datos.